ProteoWizard
Class Index
a | b | c | d | e | f | g | h | i | k | l | m | n | o | p | q | r | s | t | u | v | w | x | z
  a  
DelimReader (pwiz::identdata)   Modification (pwiz::proteome)   Publication (pwiz::tradata)   SpectrumList_ABI (pwiz::msdata::detail)   
DelimWriter (pwiz::identdata)   Modification (pwiz::tradata)   
  q  
SpectrumList_ABI_T2D (pwiz::msdata::detail)   
Activation (pwiz::msdata)   Diff (pwiz::data)   Modification (pwiz::identdata)   SpectrumList_Agilent (pwiz::msdata::detail)   
AdaptedErrorDerivative (pwiz::frequency::DerivativeTest)   DiffConfig (pwiz::msdata)   ModificationInfo (pwiz::data::pepxml)   Q3RatioResult (pwiz::data::pepxml)   SpectrumList_Bruker (pwiz::msdata::detail)   
AdaptedErrorFunction (pwiz::frequency::DerivativeTest)   DiffConfig (pwiz::proteome)   ModificationList (pwiz::proteome)   
  r  
SpectrumList_BTDX (pwiz::msdata)   
AlternativeProtein (pwiz::data::pepxml)   DiffConfig (pwiz::tradata)   ModificationMap (pwiz::proteome)   SpectrumList_ChargeFromIsotope (pwiz::analysis)   
AmbiguousResidue (pwiz::identdata)   DiffConfig (pwiz::identdata)   mru_list (pwiz::util)   random_access_compressed_ifstream (pwiz::util)   SpectrumList_ChargeStateCalculator (pwiz::analysis)   
AminoAcidModification (pwiz::data::pepxml)   DigestedPeptide (pwiz::proteome)   MS2Deisotoper (pwiz::analysis)   RawMassDatum   SpectrumList_Filter (pwiz::analysis)   
AnalysisCollection (pwiz::identdata)   DigestedPeptideLessThan   MS2NoiseFilter (pwiz::analysis)   Reader (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_ActivationType (pwiz::analysis)   
AnalysisData (pwiz::identdata)   Digestion (pwiz::proteome)   MSData (pwiz::msdata)   Reader (pwiz::proteome)   SpectrumList_FilterPredicate_AnalyzerType (pwiz::analysis)   
AnalysisProtocolCollection (pwiz::identdata)   DistributionPoint (pwiz::data::pepxml)   MSDataAnalyzer (pwiz::analysis)   Reader (pwiz::tradata)   SpectrumList_FilterPredicate_ChargeStateSet (pwiz::analysis)   
AnalysisResult (pwiz::data::pepxml)   KernelTraits::Dummy (pwiz::math::MatchedFilter)   MSDataAnalyzerContainer (pwiz::analysis)   Reader (pwiz::identdata)   SpectrumList_FilterPredicate_DefaultArrayLengthSet (pwiz::analysis)   
AnalysisSampleCollection (pwiz::identdata)   
  e  
MSDataAnalyzerDriver (pwiz::analysis)   Reader1   SpectrumList_FilterPredicate_IndexSet (pwiz::analysis)   
AnalysisSoftware (pwiz::identdata)   MSDataCache (pwiz::analysis)   Reader2   SpectrumList_FilterPredicate_MSLevelSet (pwiz::analysis)   
AnalysisSummary (pwiz::data::pepxml)   Element (pwiz::chemistry::detail)   MSDataFile (pwiz::msdata)   Reader_ABI (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_MzPresent (pwiz::analysis)   
AnalysisTimestamp (pwiz::data::pepxml)   Index::Entry (pwiz::data)   MSDataMerger (pwiz::msdata)   Reader_ABI_T2D (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_Polarity (pwiz::analysis)   
analyzer_strings (pwiz::analysis)   EnzymaticSearchConstraint (pwiz::data::pepxml)   MSDataWithSettableVersion   Reader_Agilent (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_PrecursorMzSet (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< MetadataReporter > (pwiz::analysis)   Enzyme (pwiz::identdata)   MSIHandler (pwiz::util)   Reader_Bruker (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_ScanEventSet (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RegionSIC > (pwiz::analysis)   EnzymePtr_missedCleavages   MSInspectRecordBuilder (pwiz::peptideid)   Reader_BTDX (pwiz::msdata)   SpectrumList_FilterPredicate_ScanNumberSet (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RegionSlice > (pwiz::analysis)   EnzymePtr_specificity   MSLevelSorter   Reader_FASTA (pwiz::proteome)   SpectrumList_FilterPredicate_ScanTimeRange (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RegionTIC > (pwiz::analysis)   Enzymes (pwiz::identdata)   MSMSPipelineAnalysis (pwiz::data::pepxml)   Reader_MGF (pwiz::msdata)   SpectrumList_IonMobility (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< RunSummary > (pwiz::analysis)   ParametrizedFunction::ErrorFunction (pwiz::frequency)   MSMSRunSummary (pwiz::data::pepxml)   Reader_MSn (pwiz::msdata)   SpectrumList_LockmassRefiner (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< SpectrumBinaryData > (pwiz::analysis)   ErrorPoint (pwiz::data::pepxml)   MSnHeader (pwiz::msdata)   Reader_mz5 (pwiz::msdata)   SpectrumList_MetadataFixer (pwiz::analysis)   
analyzer_strings< SpectrumTable > (pwiz::analysis)   EvenMS2Predicate   MyBase   Reader_mzML (pwiz::msdata)   SpectrumList_MGF (pwiz::msdata)   
AnotherRootHandler   EvenPredicate   MyPred   Reader_mzXML (pwiz::msdata)   SpectrumList_MSn (pwiz::msdata)   
Handler::Attributes::attribute (pwiz::minimxml::SAXParser)   EvenRequester   MyWrapper   Reader_Shimadzu (pwiz::msdata)   SpectrumList_mzML (pwiz::msdata)   
Handler::Attributes (pwiz::minimxml::SAXParser)   Evidence (pwiz::tradata)   MZIntensityPair (pwiz::msdata)   Reader_Thermo (pwiz::msdata)   SpectrumList_MZRefiner (pwiz::analysis)   
XMLWriter::Attributes (pwiz::minimxml)   ExtendedReaderList (pwiz::msdata)   mzrtEqual   Reader_UIMF (pwiz::msdata)   SpectrumList_MZWindow (pwiz::analysis)   
  b  
ExtraZeroSamplesFilter (pwiz::analysis)   MZRTField (pwiz::analysis)   Reader_Waters (pwiz::msdata)   SpectrumList_mzXML (pwiz::msdata)   
  f  
MZTolerance (pwiz::chemistry)   Reader1::ReaderConfig   SpectrumList_PeakFilter (pwiz::analysis)   
BadListener   
  n  
Reader2::ReaderConfig   SpectrumList_PeakPicker (pwiz::analysis)   
BaseDiffConfig (pwiz::data)   Feature (pwiz::data::peakdata)   ReaderFail (pwiz::msdata)   SpectrumList_PrecursorRecalculator (pwiz::analysis)   
basic_charcounter (pwiz::minimxml)   FeatureDetector (pwiz::analysis)   nativeID_less (pwiz::peptideid)   ReaderFail (pwiz::proteome)   SpectrumList_PrecursorRefine (pwiz::analysis)   
BibliographicReference (pwiz::identdata)   FeatureDetectorPeakel (pwiz::analysis)   NestedHandler   ReaderFail (pwiz::tradata)   SpectrumList_ScanSummer (pwiz::analysis)   
Bin1D (ralab::base::resample)   FeatureDetectorSimple (pwiz::analysis)   PeakFamilyDetectorFT::NoDataException (pwiz::analysis)   ReaderFail (pwiz::identdata)   SpectrumList_Smoother (pwiz::analysis)   
BinaryDataArray (pwiz::msdata)   FeatureFile (pwiz::data::peakdata)   Noise (pwiz::analysis)   ReaderList (pwiz::proteome)   SpectrumList_Sorter (pwiz::analysis)   
BinaryDataEncoder (pwiz::msdata)   FeatureModeler (pwiz::analysis)   NoiseCalculator (pwiz::analysis)   ReaderList (pwiz::tradata)   SpectrumList_SorterPredicate_ScanStartTime (pwiz::analysis)   
BinaryIndexStream (pwiz::data)   FeatureModeler_Gaussian (pwiz::analysis)   NoiseCalculator_2Pass (pwiz::analysis)   ReaderList (pwiz::identdata)   SpectrumList_Thermo (pwiz::msdata::detail)   
Bucket1D (ralab::base::resample)   Fifth   NoVendorPeakPickingException (pwiz::analysis)   ReaderList (pwiz::msdata)   SpectrumList_TitleMaker (pwiz::analysis)   
  c  
FifthHandler   NthPower (ralab::base::stats)   Record (pwiz::proteome::AminoAcid::Info)   SpectrumList_UIMF (pwiz::msdata::detail)   
FileContent (pwiz::msdata)   
  o  
PepxmlRecordReader::record (pwiz::analysis)   SpectrumList_Waters (pwiz::msdata::detail)   
SpectrumListCache::CacheEntry (pwiz::msdata)   FileDescription (pwiz::msdata)   Record (pwiz::chemistry::Element::Info)   SpectrumList_ZeroSamplesFilter (pwiz::analysis)   
CalibrationParameters (pwiz::data)   Filter (pwiz::identdata)   OBO (pwiz::data)   MSIHandler::Record (pwiz::util)   SpectrumListBase (pwiz::msdata)   
CancelListener   FilterWrapper   once_flag_proxy (pwiz::util)   IPIFASTADatabase::Record (pwiz::proteome)   SpectrumListCache (pwiz::msdata)   
CancelProgressCallback   First   OneMinusAbs   PeptideID::Record (pwiz::peptideid)   SpectrumListFactory (pwiz::analysis)   
basic_charcounter::category (pwiz::minimxml)   FirstHandler   OrderedPair (pwiz::math)   RegexCVMap (pwiz::identdata)   SpectrumListSimple (pwiz::msdata)   
CharIndexedVector (pwiz::util)   FlatRecordBuilder (pwiz::peptideid)   OrderedPairContainerRef (pwiz::math)   RegionAnalyzer (pwiz::analysis)   SpectrumListWrapper (pwiz::msdata)   
CharIndexedVectorConstIterator (pwiz::util)   Formula (pwiz::chemistry)   Organization (pwiz::identdata)   RegionSIC (pwiz::analysis)   SpectrumQuery (pwiz::data::pepxml)   
CharIndexedVectorIterator (pwiz::util)   FragmentArray (pwiz::identdata)   organization_p (pwiz::identdata)   RegionSlice (pwiz::analysis)   RegionAnalyzer::SpectrumStats (pwiz::analysis)   
Chromatogram (pwiz::msdata)   Fragmentation (pwiz::proteome)   XMLWriter::OutputObserver (pwiz::minimxml)   RegionTIC (pwiz::analysis)   SpectrumTable (pwiz::analysis)   
ChromatogramDataFilter (pwiz::analysis)   FrequencyData (pwiz::data)   
  p  
Residue (pwiz::identdata)   SpectrumWorkerThreads (pwiz::msdata)   
ChromatogramIdentity (pwiz::msdata)   FrequencyEstimator (pwiz::frequency)   RetentionTime (pwiz::tradata)   SquareRoot (ralab::base::resample)   
ChromatogramList (pwiz::msdata)   FrequencyEstimatorPhysicalModel (pwiz::frequency)   pairData   ridgeLine   Stats (pwiz::math)   
ChromatogramList_ABI (pwiz::msdata::detail)   FrequencyEstimatorSimple (pwiz::frequency)   Parabola (pwiz::math)   RocDataPoint (pwiz::data::pepxml)   RegionAnalyzer::Stats (pwiz::analysis)   
ChromatogramList_Agilent (pwiz::msdata::detail)   FTMSCompFunctor (ralab::base::resample)   ParamContainer (pwiz::data)   Root   Handler::Status (pwiz::minimxml::SAXParser)   
ChromatogramList_Bruker (pwiz::msdata::detail)   FTSieve   Parameter (pwiz::data::pepxml)   RootHandler   StringMatchCVMap (pwiz::identdata)   
ChromatogramList_mzML (pwiz::msdata)   
  g  
Software::Parameter (pwiz::data::peakdata)   rtimeMap   SubstitutionModification (pwiz::identdata)   
ChromatogramList_Shimadzu (pwiz::msdata::detail)   ParameterEstimator (pwiz::frequency)   RTMatches_Any (pwiz::analysis)   
  t  
ChromatogramList_Thermo (pwiz::msdata::detail)   Gauss (ralab::base::filter::utilities)   ParametrizedCosine   RTMatches_Contains (pwiz::analysis)   
ChromatogramList_Waters (pwiz::msdata::detail)   Gauss_1deriv (ralab::base::filter::utilities)   ParametrizedDerivativeSlice (pwiz::frequency::DerivativeTest)   RTMatches_IsContainedIn (pwiz::analysis)   TabHandler (pwiz::util)   
ChromatogramListBase (pwiz::msdata)   Goober   ParametrizedFunction (pwiz::frequency)   Run (pwiz::msdata)   TabReader (pwiz::util)   
ChromatogramListSimple (pwiz::msdata)   
  h  
ParametrizedFunctionSlice (pwiz::frequency::DerivativeTest)   RunSummary (pwiz::analysis)   TabularConfig (pwiz::analysis)   
ClickwrapPrompter (pwiz::util)   ParamGroup (pwiz::data)   
  s  
Target (pwiz::msdata)   
Image::Color (pwiz::util)   Handler (pwiz::minimxml::SAXParser)   parentIon   Target (pwiz::tradata)   
Component (pwiz::msdata)   HandlerFeature (pwiz::data::peakdata)   Peak (pwiz::analysis)   Same (pwiz::data::diff_impl)   TargetList (pwiz::tradata)   
ComponentList (pwiz::msdata)   HandlerPeak (pwiz::data::peakdata)   Peak (pwiz::data::peakdata)   SameDeep (pwiz::data::diff_impl)   Term (pwiz::data)   
Compound (pwiz::tradata)   HandlerPeakel (pwiz::data::peakdata)   PeakData (pwiz::data::peakdata)   Sample (pwiz::msdata)   TestAminoAcid   
MS2Deisotoper::Config (pwiz::analysis)   HasBinaryDataPredicate   PeakDetector (pwiz::analysis)   Sample (pwiz::identdata)   TestChargeStateCalculator   
MS2NoiseFilter::Config (pwiz::analysis)   HasID (pwiz::data::diff_impl)   PeakDetector (pwiz::frequency)   SampleDatum (pwiz::data)   TestData   
PrecursorMassFilter::Config (pwiz::analysis)   HermiteInterpolate (ralab::base::base::utilities)   PeakDetectorMatchedFilter (pwiz::frequency)   SampledData (pwiz::math::MatchedFilter)   TestDatum   
Reader::Config (pwiz::msdata)   
  i  
PeakDetectorNaive (pwiz::frequency)   SampleEnzyme (pwiz::data::pepxml)   TestDeisotopeCalculator   
PrecursorRecalculatorDefault::Config (pwiz::analysis)   Peakel (pwiz::data::peakdata)   SamplingWith (ralab::base::resample)   TestDeisotoper   
Serializer_mzML::Config (pwiz::msdata)   id_p (pwiz::identdata)   PeakelGrower (pwiz::analysis)   SavitzkyGolaySmoother (pwiz::analysis)   TestETDMassFilter   
Serializer_mzXML::Config (pwiz::msdata)   IdentData (pwiz::identdata)   PeakelGrower_Proximity (pwiz::analysis)   saxstring (pwiz::minimxml::SAXParser)   TestFormula   
SpectrumIterator::Config (pwiz::msdata)   IdentDataFile (pwiz::identdata)   PeakelPicker (pwiz::analysis)   Scan (pwiz::data::peakdata)   TestFragmentation   
Digestion::Config (pwiz::proteome)   Identifiable (pwiz::identdata)   PeakelPicker_Basic (pwiz::analysis)   Scan (pwiz::msdata)   TestInfo   
FrequencyEstimatorPhysicalModel::Config (pwiz::frequency)   IdentifiableParamContainer (pwiz::identdata)   PeakExtractor (pwiz::analysis)   ScanList (pwiz::msdata)   TestIterationListener   
Reader_FASTA::Config (pwiz::proteome)   Image (pwiz::util)   PeakFamily (pwiz::data::peakdata)   ScanSettings (pwiz::msdata)   TestIterationListener_WithCancel   
Serializer_FASTA::Config (pwiz::proteome)   Index (pwiz::data)   PeakFamilyDetector (pwiz::analysis)   ScanWindow (pwiz::msdata)   TestListener   
PeakDetectorMatchedFilter::Config (pwiz::frequency)   Index_mzML (pwiz::msdata)   PeakFamilyDetectorFT (pwiz::analysis)   PeakDetectorMatchedFilter::Score (pwiz::frequency)   TestMetadataFixer   
IsotopeEnvelopeEstimator::Config (pwiz::chemistry)   SpectrumList_mzXML::index_not_found (pwiz::msdata)   PeakFinder (pwiz::analysis)   scoreChain   TestModification   
MSDataCache::Config (pwiz::analysis)   IndexList (pwiz::msdata)   PeakFinder_SNR (pwiz::analysis)   SearchDatabase (pwiz::identdata)   TestModifiedPeptide   
PepxmlRecordReader::Config (pwiz::analysis)   IndexList (pwiz::proteome)   PeakFitter (pwiz::analysis)   SearchDatabase (pwiz::data::pepxml)   TestMS2Denoise   
XMLWriter::Config (pwiz::minimxml)   Inputs (pwiz::identdata)   PeakFitter_Parabola (pwiz::analysis)   SearchHit (pwiz::data::pepxml)   TestOperator   
RegionAnalyzer::Config (pwiz::analysis)   Instrument (pwiz::tradata)   PeakPicker (ralab::base::ms)   SearchModification (pwiz::identdata)   TestOutputObserver   
RegionSIC::Config (pwiz::analysis)   InstrumentConfiguration (pwiz::msdata)   Pep2MzIdent (pwiz::identdata)   SearchResult (pwiz::data::pepxml)   TestPair   
RegionSlice::Config (pwiz::analysis)   IntegerSet (pwiz::util)   Peptide (pwiz::proteome)   SearchScore (pwiz::data::pepxml)   TestPathmask   
RegionTIC::Config (pwiz::analysis)   Interpretation (pwiz::tradata)   Peptide (pwiz::tradata)   SearchSummary (pwiz::data::pepxml)   TestPathPredicate (pwiz::util)   
RunSummary::Config (pwiz::analysis)   IntegerSet::Interval (pwiz::util)   Peptide (pwiz::identdata)   Second   TestPeptide   
SpectrumTable::Config (pwiz::analysis)   IonType (pwiz::identdata)   PeptideEvidence (pwiz::identdata)   SecondHandler   TestReader   
SpectrumBinaryData::Config (pwiz::analysis)   IPIFASTADatabase (pwiz::proteome)   PeptideHypothesis (pwiz::identdata)   SelectedIndexPredicate   TestScanSummerCalculator   
FeatureDetectorPeakel::Config (pwiz::analysis)   Is_T2D_Directory   PeptideID (pwiz::peptideid)   SelectedIon (pwiz::msdata)   TestSpectrumInfo   
Reader::Config (pwiz::identdata)   IsDirectory   PeptideID_flat (pwiz::peptideid)   seq_p (pwiz::identdata)   TestThresholder   
Reader1::Config   isoChain   PeptideID_pepXml (pwiz::peptideid)   SeqMinus (ralab::base::base::utilities)   TextWriter (pwiz::identdata)   
Reader2::Config   IsolationWindow (pwiz::msdata)   PeptideIDMap (pwiz::peptideid)   SeqPlus (ralab::base::base::utilities)   TextWriter (pwiz::tradata)   
Serializer_mzIdentML::Config (pwiz::identdata)   Isotope (pwiz::chemistry::detail)   PeptideProphetResult (pwiz::data::pepxml)   sequence_p (pwiz::identdata)   TextWriter (pwiz::proteome)   
Serializer_pepXML::Config (pwiz::identdata)   IsotopeCalculator (pwiz::chemistry)   PeptideProphetSummary (pwiz::data::pepxml)   SequenceCollection (pwiz::identdata)   TextWriter (pwiz::msdata)   
Serializer_Text::Config (pwiz::identdata)   isotopeChain   PepxmlRecordReader (pwiz::analysis)   Serializer_FASTA (pwiz::proteome)   ThreadStatus   
Serializer_protXML::Config (pwiz::identdata)   IsotopeEnvelopeEstimator (pwiz::chemistry)   PepXMLSpecificity (pwiz::identdata)   Serializer_MGF (pwiz::msdata)   ThresholdFilter (pwiz::analysis)   
NoiseCalculator_2Pass::Config (pwiz::analysis)   IsotopeTable (pwiz::chemistry)   Person (pwiz::identdata)   Serializer_MSn (pwiz::msdata)   TimeIntensityPair (pwiz::msdata)   
PeakelGrower_Proximity::Config (pwiz::analysis)   IsRawData   person_p (pwiz::identdata)   Serializer_mzIdentML (pwiz::identdata)   Timer (pwiz::util)   
PeakelPicker_Basic::Config (pwiz::analysis)   IsRawFile   Image::Point (pwiz::util)   Serializer_mzML (pwiz::msdata)   TraData (pwiz::tradata)   
PeakFamilyDetectorFT::Config (pwiz::analysis)   IsWiffFile   PPMCompFunctor (ralab::base::resample)   Serializer_mzXML (pwiz::msdata)   TraDataFile (pwiz::tradata)   
PeakFinder_SNR::Config (pwiz::analysis)   IterationListener (pwiz::util)   Precursor (pwiz::msdata)   Serializer_pepXML (pwiz::identdata)   Transition (pwiz::tradata)   
PeakFitter_Parabola::Config (pwiz::analysis)   IterationListenerRegistry (pwiz::util)   Precursor (pwiz::tradata)   Serializer_protXML (pwiz::identdata)   TranslationTable (pwiz::identdata)   
BinaryDataEncoder::Config (pwiz::msdata)   PeptideID::Iterator (pwiz::peptideid)   precursorGroup   Serializer_Text (pwiz::identdata)   TruncatedLorentzian (pwiz::frequency)   
Configuration (pwiz::tradata)   IntegerSet::Iterator (pwiz::util)   PrecursorRecalculator::PrecursorInfo (pwiz::analysis)   Serializer_traML (pwiz::tradata)   TruncatedLorentzianEstimator (pwiz::frequency)   
Digestion::const_iterator (pwiz::proteome)   PeptideID::IteratorInternal (pwiz::peptideid)   SpectrumInfo::PrecursorInfo (pwiz::msdata)   SetRetentionTime   TruncatedLorentzianParameters (pwiz::frequency)   
Contact (pwiz::msdata)   
  k  
SpectrumList_PrecursorRefine::PrecursorInfo (pwiz::analysis)   SHA1_ostream (pwiz::util)   
  u  
Contact (pwiz::tradata)   PrecursorMassFilter (pwiz::analysis)   SHA1_WORKSPACE_BLOCK   
Contact (pwiz::identdata)   KernelTraits (pwiz::math::MatchedFilter)   PrecursorRecalculator (pwiz::analysis)   SHA1Calculator (pwiz::util)   IterationListener::UpdateMessage (pwiz::util)   
ContactRole (pwiz::identdata)   KernelTraitsBase (pwiz::math::MatchedFilter)   PrecursorRecalculatorDefault (pwiz::analysis)   SHA1Filter (pwiz::util)   usage_exception (pwiz::util)   
Convert2Dense (ralab::base::resample)   KernelTraitsBase< Y(*)(X)> (pwiz::math::MatchedFilter)   ProteinList_DecoyGenerator::Predicate (pwiz::analysis)   SHA1OutputObserver (pwiz::msdata)   user_error (pwiz::util)   
Correlation (pwiz::math::MatchedFilter)   
  l  
ProteinList_Filter::Predicate (pwiz::analysis)   SHA1SymmetricFilter (pwiz::util)   UserParam (pwiz::data)   
CosineInterpolate (ralab::base::base::utilities)   SpectrumList_Filter::Predicate (pwiz::analysis)   shared_map (pwiz::util)   UserParamNameIs   
CSHA1   LegacyAdapter_Instrument (pwiz::msdata)   SpectrumList_Sorter::Predicate (pwiz::analysis)   SpectrumIterator::Sieve (pwiz::msdata)   
  v  
CubicInterpolate (ralab::base::base::utilities)   LegacyAdapter_Software (pwiz::msdata)   Prediction (pwiz::tradata)   Simple   
CustomPair   LinearInterpolate (ralab::base::base::utilities)   PrintAttribute   SimpleAnalyzer   Validation (pwiz::tradata)   
CV (pwiz::cv)   LinearLeastSquares (pwiz::math)   PrintEventHandler   SimplePeakArea (ralab::base::ms)   VectorFunction (pwiz::frequency::DerivativeTest)   
CVIDMatchCVMap (pwiz::identdata)   LinearLeastSquares< LinearLeastSquaresType_LU > (pwiz::math)   ProcessingMethod (pwiz::msdata)   SimplePicker (ralab::base::ms)   VectorTabHandler (pwiz::util)   
CVMap (pwiz::identdata)   LinearLeastSquares< LinearLeastSquaresType_QR > (pwiz::math)   Product (pwiz::msdata)   SimpleProgressCallback   Version (pwiz::msdata)   
CVParam (pwiz::data)   LinearSolver (pwiz::math)   Product (pwiz::tradata)   Smoother (pwiz::analysis)   Version (pwiz::analysis)   
CVParamIs (pwiz::data)   LinearSolver< LinearSolverType_LU > (pwiz::math)   ProductSpace (pwiz::math::MatchedFilter)   Software (pwiz::msdata)   Version (pwiz::identdata)   
CVParamIsChildOf (pwiz::data)   LinearSolver< LinearSolverType_QR > (pwiz::math)   MSDataAnalyzerDriver::ProgressCallback (pwiz::analysis)   Software (pwiz::data::peakdata)   Version (pwiz)   
CVTermInfo (pwiz::cv)   LocalMaximumPeakDetector (pwiz::analysis)   Protein (pwiz::proteome)   Software (pwiz::tradata)   Version (pwiz::tradata)   
CVTranslator (pwiz::data)   LocalMinPeakArea (ralab::base::ms)   Protein (pwiz::tradata)   software_p (pwiz::identdata)   Version (pwiz::proteome)   
CwtPeakDetector (pwiz::analysis)   PeptideID::Location (pwiz::peptideid)   ProteinAmbiguityGroup (pwiz::identdata)   SourceFile (pwiz::msdata)   virtual_map (pwiz::util)   
  d  
location_less (pwiz::peptideid)   ProteinDetection (pwiz::identdata)   SourceFile (pwiz::identdata)   
  w  
  m  
ProteinDetectionHypothesis (pwiz::identdata)   Specificity (pwiz::data::pepxml)   
DaCompFunctor (ralab::base::resample)   ProteinDetectionList (pwiz::identdata)   SpectraData (pwiz::identdata)   WhittakerSmoother (pwiz::analysis)   
DatabaseTranslation (pwiz::identdata)   MagnitudeLorentzian (pwiz::frequency)   ProteinDetectionProtocol (pwiz::identdata)   Spectrum (pwiz::msdata)   TraDataFile::WriteConfig (pwiz::tradata)   
DataCollection (pwiz::identdata)   MascotReader (pwiz::identdata)   ProteinList (pwiz::proteome)   SpectrumBinaryData (pwiz::analysis)   IdentDataFile::WriteConfig (pwiz::identdata)   
DataFilter (pwiz::data::pepxml)   MassAbundance (pwiz::chemistry)   ProteinList_DecoyGenerator (pwiz::analysis)   SpectrumDataFilter (pwiz::analysis)   ProteomeDataFile::WriteConfig (pwiz::proteome)   
MSDataAnalyzer::DataInfo (pwiz::analysis)   MassTable (pwiz::identdata)   ProteinList_DecoyGeneratorPredicate_Reversed (pwiz::analysis)   SpectrumIdentification (pwiz::identdata)   MSDataFile::WriteConfig (pwiz::msdata)   
DataProcessing (pwiz::msdata)   Match (pwiz::data::pepxml)   ProteinList_DecoyGeneratorPredicate_Shuffled (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationItem (pwiz::identdata)   WriteCVParam   
DatasetDerivation (pwiz::data::pepxml)   MatchData (pwiz::data::pepxml)   ProteinList_Filter (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationList (pwiz::identdata)   
  x  
Datum   meanfunctor (ralab::base::resample::utilities)   ProteinList_FilterPredicate_IdSet (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationProtocol (pwiz::identdata)   
DBSequence (pwiz::identdata)   Measure (pwiz::identdata)   ProteinList_FilterPredicate_IndexSet (pwiz::analysis)   SpectrumIdentificationResult (pwiz::identdata)   XMLWriter (pwiz::minimxml)   
dbsequence_p (pwiz::identdata)   MemoryIndex (pwiz::data)   ProteinListCache (pwiz::proteome)   SpectrumIdentity (pwiz::msdata)   
  z  
DefaultArrayLengthSorter   MemoryMRUCache (pwiz::msdata)   ProteinListFactory (pwiz::analysis)   SpectrumIdentityFromMzXML (pwiz::msdata)   
DefaultReaderList (pwiz::proteome)   MetadataReporter (pwiz::analysis)   ProteinListSimple (pwiz::proteome)   SpectrumIdentityFromXML (pwiz::msdata)   ZeroSampleFiller (pwiz::analysis)   
DefaultReaderList (pwiz::tradata)   Mexican_Hat (ralab::base::filter::utilities)   ProteinListWrapper (pwiz::proteome)   SpectrumInfo (pwiz::msdata)   
DefaultReaderList (pwiz::identdata)   Mexican_Hat2 (ralab::base::filter::utilities)   ProteomeData (pwiz::proteome)   SpectrumIterator (pwiz::msdata)   
DefaultReaderList (pwiz::msdata)   MixtureModel (pwiz::data::pepxml)   ProteomeDataFile (pwiz::proteome)   SpectrumList (pwiz::msdata)   
DefaultTabHandler (pwiz::util)   ModAminoAcidMass (pwiz::data::pepxml)   Provider (pwiz::identdata)   SpectrumList_3D (pwiz::analysis)   
a | b | c | d | e | f | g | h | i | k | l | m | n | o | p | q | r | s | t | u | v | w | x | z